В 1889 году при Никольской мануфактуре Саввы Морозова было открыто Никольское начальное училище. В 1890 году при училище был построен храм во имя святителя Николая Чудотворца. Инициатором строительства выступил Савва Тимофеевич Морозов, известный промышленник и меценат. Архитектурный проект храма был выполнен в русском стиле, характерном для церковного зодчества конца XIX века.
В советский период храм, как и многие религиозные сооружения, подвергся закрытию. Здание использовалось в различных светских целях, что привело к утрате многих элементов внутреннего убранства. Однако внешняя архитектура храма сохранилась, что позволило в дальнейшем провести реставрационные работы.
В 1990-х годах, с возрождением религиозной жизни в России, начался процесс возвращения храма Русской Православной Церкви. Были проведены реставрационные работы, направленные на восстановление первоначального облика здания и его внутреннего убранства. В настоящее время храм является действующим и выполняет функции духовного и образовательного центра.
При храме действует Никольская классическая гимназия, открытая в 2012 году. Кроме того, функционируют Богословско-катехизаторские курсы и Воскресная школа, проводятся огласительные беседы перед Таинством Крещения, а также оказывается гуманитарная помощь малоимущим. Богослужения в храме совершаются ежедневно.