Строительство храма было инициировано в начале XX века в рамках создания комплекса зданий заводской больницы Никольской мануфактуры. Финансирование проекта осуществлялось известным промышленником и меценатом Саввой Тимофеевичем Морозовым. Архитектурный проект разработал архитектор Александр Александрович Галецкий, известный своими работами в неорусском стиле. Строительство храма было завершено между 1903 и 1906 годами.
Архитектурно храм представляет собой образец неорусского стиля, характерного для начала XX века. Здание выполнено из кирпича с использованием традиционных для русского зодчества элементов, что придает ему особую выразительность и гармонично вписывает в окружающий архитектурный ансамбль.
После Октябрьской революции 1917 года храм, как и многие религиозные сооружения, подвергся изменениям в использовании. В первые десятилетия советской власти часовню превратили в морг, а последние сорок лет здание никак не использовалось. Здание постепенно ветшало и разрушалось.
В конце 1990-х годов здание часовни было продано частному лицу, а затем оказалось в руках общины Российской православной свободной церкви. Жители района и священнослужители Орехово-Зуевского округа выступили в защиту здания и начали процесс передачи часовни в собственность Русской Православной Церкви. В 1998 году был организован приход, а юридическое оформление произошло в 2000 году. С первого молебна, который прошел 4 марта 2000 года, началось восстановление здания разрушенной часовни. По просьбе жителей города часовню решено было перестроить в храм в честь святой блаженной Ксении Петербургской.
В период восстановления храма были проведены значительные ремонтно-восстановительные работы. Были восстановлены кровля, фасады, внутреннее убранство, а также проведены работы по благоустройству прилегающей территории. При храме была создана библиотека православной литературы, организована детская воскресная школа, проводились занятия и для взрослых прихожан. Силами прихожан при расположенной рядом больнице было организовано сестричество по уходу за больными. Храм оказывает помощь "отказным детям" инфекционного отделения. Приход окормляет ОМОН, больных геронтологического отделения Верейской больницы. Храм стал центром духовного окормления окружающего микрорайона.
27 октября 2018 года по благословению митрополита Ювеналия епископ Серпуховской Роман совершил великое освящение храма блаженной Ксении Петербургской. В настоящее время храм является действующим и продолжает свою духовно-просветительскую деятельность, являясь центром притяжения для верующих и жителей города.