Согласно Писцовой книге 1623–1624 годов, на погосте Лужок в вотчине Покровского девичьего монастыря в Суздале существовала деревянная церковь во имя мученика Никиты, которая в то время стояла «без пения». Это свидетельствует о наличии храма в указанном месте уже в начале XVII века.
Народное предание гласит, что храм был возведён на заболоченном месте, где в можжевеловом кусте была обнаружена икона святого великомученика Никиты. Местные жители намеревались построить церковь на более возвышенном месте, однако икона чудесным образом возвращалась обратно, что послужило основанием для строительства храма именно на месте её обретения.
К середине XIX века деревянная церковь обветшала, и прихожане во главе с церковным старостой начали хлопотать о строительстве нового каменного храма. Новый храм был построен к 1864 году с двумя зимними приделами: во имя святого Архистратига Михаила и святителя Николая. Храм получил большой колокол весом в 209 пудов 10 фунтов. Стараниями причта к 1893 году были отстроены собственные деревянные дома для священно- и церковнослужителей.
При церкви имелись постройки: церковно-приходская школа, сторожка и сарай. Никитский храм превратился в начале XX века в центр образования для всей округи. Неподалёку от храма находится источник святого великомученика Никиты, на котором раньше служились водосвятные молебны.
После Октябрьской революции 1917 года начались гонения на Русскую православную церковь. В 1922 году из храма было конфисковано большое серебряное распятие и ценные оклады с икон. Бронзовые купола были отправлены на переплавку, а большой колокол весом в 209 пудов был разбит. В такой обстановке жизнь Никитского прихода стала очень сложной, и многие местные жители боялись посещать храм. Однако усилиями прихожан церковь была спасена от закрытия и разрушения.
В послевоенные годы Никитский храм вновь находился под пристальным вниманием властей, и советские чиновники неоднократно пытались полностью прекратить его деятельность. Однако середина 1980-х годов стала периодом возрождения церкви великомученика Никиты в селе Строкино и духовной жизни в округе. Усилиями настоятелей и прихожан храм был отреставрирован снаружи, позолочены купола, восстановлены настенные росписи и деревянная резьба иконостасов.
