В конце XIX — начале XX века восточная окраина Сергиева Посада, известная как Красюковка, принадлежала Михаилу Николаевичу Красюку, отставному генералу и благотворителю. Он активно участвовал в деятельности местного отделения Красного Креста во время русско-турецкой войны 1877–1878 годов, занимая должность казначея. На средства, накопленные за годы службы, и пожертвования императора после войны, Красюк начал приобретать земельные участки в восточном пригороде Сергиева Посада. Со временем этот район получил название Красюковка в честь своего владельца.
В 1902–1903 годах Михаил Красюк, по благословению своего духовника, старца Варнавы Гефсиманского (впоследствии канонизированного), построил на своей земле храм во имя своего небесного покровителя — Архангела Михаила. По преданию, сам старец Варнава определил место для сооружения дома, богадельни и домовой церкви. Первоначально храм располагался на втором этаже кирпичного здания, а на первом этаже находился приют для инвалидов. Со временем церковь приобрела статус приходской.
Архитектурно храм представляет собой трехэтажное здание башнеобразного типа, выполненное из красного кирпича. Основной объем храма — восьмигранная башня, перекрытая низкой полусферической кровлей, увенчанной звонницей. К двум нижним этажам с запада примыкает прямоугольная трапезная. Внутреннее пространство перекрыто фигурными сводами. К югу от трапезной расположен двухэтажный церковно-приходской дом, нижний этаж которого каменный, а верхний — деревянный. Декор фасадов включает широкие парные лопатки, пояс из фигурных ниш-филенок и зубчатые обрамления окон среднего яруса.
После революции 1917 года и последовавших за ней социальных потрясений, храм продолжал оставаться центром духовной жизни для многих верующих. В 1919 году в Михайловском храме отпевали известного русского философа Василия Розанова, проживавшего в последние годы жизни в этом районе. В церемонии участвовали священник Павел Флоренский и инспектор Московской духовной академии Иларион (Троицкий).
В 1930 году, в период антирелигиозной политики советской власти, храм был закрыт. В его здании поочередно размещались начальная школа, медицинское училище и производственные организации. За время использования не по назначению помещения храма были перестроены, и многие из них пришли в запущенное состояние.
В сентябре 1990 года Михаило-Архангельский храм был возвращен Русской Православной Церкви. Первая Божественная литургия во вновь открытом храме состоялась 21 октября 1990 года. С тех пор усилиями прихожан и духовенства храм был восстановлен и продолжает функционировать как центр духовной жизни района. Из святынь храма следует отметить икону праведной Матроны Московской с частицей ее мощей.
