Первое упоминание о селе Иванисово относится к 1627–1628 годам, когда в писцовых книгах упоминается деревянная церковь во имя Михаила Архангела «на погосте на реке Раменке». Село в разное время принадлежало знатным родам Шереметевых, Одоевских, Толстых, Голицыных, Всеволожских, Долгоруковых, Адуевских и Ушаковых.
Ныне существующий каменный храм в честь Казанской иконы Божией Матери был построен в 1825–1838 годах на месте старой деревянной церкви Михаила Архангела. Строительство велось на средства генерал-адъютанта Николая Мартемьяновича Сипягина и генерал-лейтенанта Василия Дмитриевича Иловайского, участников Отечественной войны 1812 года.
Архитектурно храм выполнен в стиле ампир. Входы в храм оформлены выступающими притворами с четырехколонными портиками дорического ордера. Лаконичный декор компенсируется необычностью композиции объемов здания.
Внутренние росписи храма относятся к 1857 году, но позднее неоднократно обновлялись. Иконостасы были установлены во второй половине XIX века.
В советское время храм был закрыт лишь на несколько лет. В этот период здесь служили священники Димитрий Зернов и Петр Постников. В 1930 году отец Димитрий был арестован и выслан, но вернулся из ссылки в 1934 году. Отец Петр был арестован в 1932 году и выслан на 5 лет. После них службу вел священник Феодор Недосекин, который в 1937 году был арестован и сослан в Карелию, где умер в 1942 году. Храм был закрыт с 1937 по 1944 годы.
После открытия в 1944 году храм продолжил свою деятельность и остается действующим по сей день. Он является центром духовной жизни села Иванисово и окрестных населенных пунктов.