Строительство каменного храма во имя Иоанна Предтечи было инициировано владельцем села Фряново и местной фабрики Иваном Лазаревичем Лазаревым в 1779 году. Храм возводился по проекту известных архитекторов Юрия Матвеевича Фельтена, автора многих построек в Санкт-Петербурге, и Ивана Михайловича Подьячева, уроженца этих мест. Строительство завершилось в 1797 году, и храм был освящён в честь Собора Иоанна Предтечи.
Архитектурно храм выполнен в стиле зрелого классицизма. В плане он имеет форму латинского креста с боковыми фасадами, украшенными четырёхколонными портиками. Особенностью конструкции является двойной купол с внутренними и внешними окошками: внутренние — круглые, внешние — полукруглые, через которые видно внутренний купол. Западная часть представляет собой трапезную с приделами в честь Казанской иконы Божией Матери и преподобного Андрея Критского. Трапезная имеет вальмовую кровлю с полуциркульными чердачными окнами. Лестничное помещение соединяет трапезную с трёхъярусной колокольней, состоящей из двух четвериков и ротонды.
После смерти Ивана Лазаревича Лазарева в 1801 году внутреннее убранство храма осталось незавершённым. Сооружённый позднее иконостас был примитивен, живопись отсутствовала. В 1842 году храм украсили богатым центральным иконостасом, главы и кресты были позолочены. В 1853 году пол устлали чугунными плитами, а в 1870 году интерьер храма был расписан. В 1882 году московский купец А.С. Рещиков пожертвовал храму большой колокол весом 308 пудов. Ремонтные работы проводились в 1888 и 1891 годах. В 1903 году на церковные сбережения, пожертвования верующих и старосты храма С.В. Залогина был установлен новый резной вызолоченный иконостас, выполненный известным московским мастером Я.Е. Епанечниковым.
С 1902 по 1937 годы в церкви служил псаломщиком, диаконом и священником Михаил Никологорский, пострадавший в годы репрессий и ныне прославленный в лике святых.
В 1940 году храм был закрыт, и его богатое внутреннее убранство было полностью уничтожено. В годы Великой Отечественной войны здание использовали под склад и мастерские для ремонта тракторов.
В 1989 году храм был передан церковной общине, и 30 января 1990 года он вновь открылся для верующих. Были проведены реставрационные работы, и храм возобновил свою духовную деятельность.