Храм святителей Гурия, Германа и Варсонофия Казанских в городе Бирске был возведен в период с 1895 по 1898 год. Строительство осуществлялось при Бирской инородческой учительской школе, учрежденной в 1882 году. Инициаторами создания храма выступили инспектор школы Николай Павлович Вишневецкий и законоучитель священник Александр Федорович Михайлов. Финансирование строительства обеспечивалось за счет пожертвований, среди которых значительными были вклады купцов Н. С. Капустина и С. М. Белова.
Освящение храма состоялось 4 апреля 1899 года во имя святителей Гурия, Германа и Варсонофия, просветителей бывшего Казанского ханства. Архитектурное решение здания выполнено в кирпичном стиле с элементами византийской традиции, включая трехнефную базилику и восьмигранный световой барабан с витражными окнами. Отопительная система храма была организована по амосовской системе воздушного отопления с духовой печью, расположенной в подвале.
В 1919 году храм был закрыт советской властью. В последующие годы здание использовалось под комсомольский клуб, ресторан, краеведческий музей (1926-1932), электростанцию (1933), склад эвакуированного Ленинградского военного училища (1941-1945) и магазин хозяйственных товаров. Реставрационные работы начались в 1984 году, а в 1994 году здание было возвращено Уфимской епархии.
В 2002 году при храме открылась воскресная школа, а в 2003 году восстановлена звонница, разрушенная в советский период. С 2010 года храм вновь носит имя Казанских святителей. В 2012-2013 годах проведена реконструкция инженерных систем, включая замену отопления и электрики.