В 1793 году в слободе Маньково (позднее переименованной в село Синявское) была заложена первая деревянная церковь во имя Трёх Святителей. Строительство завершилось в 1794 году. Согласно клировым ведомостям 1801 года, церковь была построена на деревянных столбах, стены её были камышовыми, обмазаны глиной и покрыты лубом. Приход включал 108 дворов малороссиян (323 мужчины и 307 женщин) и 26 дворов великороссиян (117 мужчин и 98 женщин).
К началу XIX века деревянная церковь обветшала, и 25 мая 1802 года была заложена новая каменная церковь с тем же посвящением. Освящение нового храма состоялось 26 января 1806 года. Новый храм был однопрестольным, с каменной основой и колокольней, соединённой с основным зданием.
В 1869 году при храме было открыто церковно-приходское училище.
В конце XIX — начале XX века храм был расширен боковыми приделами, а в 1903 году обновлён центральный престол, освящённый во имя Всех Святых.
После Октябрьской революции 1917 года храм подвергся разграблению и был закрыт. В последующие десятилетия здание пришло в упадок.
После распада Советского Союза храм был возвращён Русской Православной Церкви и повторно освящён во имя Всех Святых. 18 мая 2006 года состоялось празднование 200-летия храма.