История храмового строительства в селе Елань-Колено восходит к началу XVIII века. В 1712 году здесь была возведена первая деревянная церковь в честь Казанской иконы Божией Матери. Этот храм простоял до 1787 года, после чего был продан в слободу Васильевка, а затем перевезён в хутор Каладеев старообрядцам. На месте старого храма была установлена каменная табличка, примерно в сорока саженях от южных дверей нового храма.
В том же 1787 году на месте прежней церкви был построен новый каменный храм, также освящённый в честь Казанской иконы Божией Матери. Первоначально он имел квадратную форму с выступающим алтарём и был без колокольни. В 1789 году к нему была пристроена колокольня, соединённая с церковью открытой галереей. В 1850 году, по инициативе священника Фёдора Абрамова, были пристроены приделы с северной и южной сторон, галерея заменена крытой трапезной, а алтарный выступ значительно удлинён и расширен, в результате чего храм принял крестообразную форму.
В конце XIX века было принято решение о строительстве нового храма. Строительство началось в 1895–1896 годах. В основание алтаря были заложены камни, привезённые со Святой Земли, из Иерусалима. Храм был освящён в 1907 году.
Архитектурно храм выполнен в русско-византийском стиле. Форма основания храма — «корабль», высота — 50 метров. Колокольня ярусная, высотой 60 метров. Храм однокупольный. Он является памятником архитектуры регионального значения.
В 1930-е годы храм был закрыт, а его священнослужители подверглись репрессиям: многие были сосланы в лагеря или расстреляны. Здание храма использовалось как склад стройматериалов.
В начале 1990-х годов храм был возвращён епархии, после чего началось его восстановление. С 1996 года в храме возобновились богослужения. 8 ноября 2020 года епископ Борисоглебский и Бутурлиновский Сергий совершил чин великого освящения храма.
