В 1863 году в селе Шапта произошло событие, послужившее началом церковной жизни: крестьянину Ивану Кугузу явилась икона Покрова Пресвятой Богородицы. В память об этом на месте явления была сооружена небольшая деревянная часовня, ставшая первым культовым сооружением в окрестностях, объединяющим верующих.
Спустя десять лет, в 1873 году, в связи с увеличением числа прихожан и потребностью в более вместительном помещении, было принято решение о строительстве деревянного храма. 1 ноября 1873 года официально открыт Шаптинский приход, а 1 апреля 1874 года началось возведение однопрестольной церкви на каменном фундаменте. К осени того же года строительство было завершено, и 11 ноября 1874 года храм освящен в честь Владимирской иконы Божией Матери.
Однако со временем деревянный храм перестал удовлетворять потребности растущего прихода. В начале XX века, в 1902 году, началось строительство нового каменного храма по проекту вятского архитектора Ивана Александровича Чарушина. Строительство продолжалось десять лет и завершилось освящением храма 8 января 1913 года, приуроченным к 100-летию победы России в Отечественной войне 1812 года.
Архитектурно новый храм представляет собой пятиглавое сооружение с колокольней, выполненное в традициях русско-византийского стиля. Фасады украшены декоративными элементами, характерными для творчества Чарушина. Внутреннее убранство включало шестиярусный иконостас с иконами греческого письма, среди которых особо выделялась редкая икона «Единородный Сын».
В советский период храм, как и многие религиозные сооружения, подвергся закрытию и использовался в различных хозяйственных целях. Однако в последующие годы, благодаря усилиям местных жителей и верующих, здание храма было сохранено и восстановлено.
