В конце XIX — начале XX века в селе Агаповка был построен храм во имя святителя Николая Чудотворца. Однако в 1930-х годах, в период антирелигиозной политики советского государства, этот храм был закрыт, а его здание не сохранилось до наших дней.
В 1995 году жители Агаповки выразили желание возвести новый православный храм. Инициатива была поддержана руководством Известняково-доломитового производства Магнитогорского металлургического комбината, которое пообещало предоставить необходимые строительные материалы. Благословение на строительство было получено от благочинного Южного округа Челябинской епархии протоиерея Флора и епископа Челябинского и Златоустовского Георгия. Существенную поддержку в реализации проекта оказал глава района Александр Давлетбаев.
Подготовительные работы продолжались около двух лет. 9 июня 1997 года был вырыт котлован под фундамент храма. Строительство осуществлялось силами строительного монтажного предприятия СМП-216 под контролем первого заместителя главы района Ильдуса Валеева и заведующей отделом строительства Валентины Шалевой. Местные художники Виктор Фатеев, Георгий Хаустов и Евгений Кухтевин на благотворительной основе занимались изготовлением Царских Врат и написанием икон. Финансирование строительства осуществлялось за счет пожертвований местных предприятий, работников Агаповского производственного управления жилищно-коммунального хозяйства и жителей села, а также поселков Магнитный и Наровчатский.
Строительство храма началось в мае 1998 года и завершилось к началу осени 2000 года. 8 сентября 2000 года митрополит Челябинский и Златоустовский Иов освятил новый храм в честь Владимирской иконы Божией Матери.
Автором проекта храма выступила челябинский архитектор Марина Анатольевна Боровых. Здание выполнено в классическом стиле и представляет собой пятиглавый четверик с крупным алтарем, пониженными боковыми галереями и шатровой колокольней. Высота храма составляет 31 метр, общая площадь — 220 квадратных метров, вместимость — около 100 человек. Стены окрашены в небесно-голубой цвет, кровли крыш — синего цвета, крыльцо и цоколь облицованы мрамором дымчато-серого оттенка.
С момента открытия храма при нем действует воскресная школа. 6 января 2003 года на Рождественском богослужении в храме присутствовал президент Российской Федерации Владимир Путин, который передал в дар храму церковную чашу (потир). Губернатор Челябинской области Петр Сумин преподнес в дар Евангелие.