В 1899 году дочь ивановского купца Е. Г. Корина и её крёстная Н. И. Щербакова выступили с предложением о создании в Иваново-Вознесенске женского монастыря в честь Владимирской иконы Божией Матери, которая являлась семейной реликвией и передавалась из поколения в поколение. Для обсуждения этой идеи в доме Н. И. Щербаковой стали собираться заинтересованные лица.
В 1900 году супруга владельца местного меднолитейного завода С. И. Жохова пожертвовала участок земли на южной окраине города, предназначенный для будущего монастыря. Братья Алексей и Александр Константиновы обнесли этот участок оградой, выкопали колодец и построили деревянный дом для организации женской богадельни, которая начала функционировать в 1901 году.
В 1902 году при финансовой поддержке ивановского предпринимателя А. Н. Дербенёва началось строительство большого каменного храма по проекту губернского архитектора П. Г. Бегена. Первоначальный проект предусматривал возведение двухэтажного здания богадельни с примыкающей к нему церковью, однако впоследствии было решено строить отдельный храм. Закладка храма состоялась 11 мая 1903 года.
Строительство храма завершилось в декабре 1904 года, когда был освящён главный престол в честь Владимирской иконы Божией Матери. Боковые приделы, посвящённые святой Марии Магдалине и преподобному Михаилу Клопскому, были освящены в декабре 1907 года. Храм был построен из красного кирпича в стиле, подражающем архитектуре московских и ярославских церквей XVII века, с пятиглавым завершением и четырёхъярусным иконостасом с иконами «древнемосковского» письма.
В 1906 году для размещения увеличившегося числа женщин, желающих проживать и трудиться при богадельне, был построен двухэтажный деревянный дом с жилыми помещениями на втором этаже и трапезной на первом. В 1908 году на основе существовавшей богадельни была официально открыта Владимирская женская община, которая в 1916 году была преобразована в монастырь, насчитывавший 76 насельниц.
После революции 1917 года монастырь подвергся изменениям: в 1918 году на его территории была создана трудовая артель, монахини продолжали заниматься сельским хозяйством и рукоделием. В 1921 году жилые корпуса монастыря были заселены студентами, а затем семьями рабочих, что привело к постепенному вытеснению насельниц. В 1928 году храм был закрыт, а в 1930 году его главы и деревянная колокольня были разрушены.
В советское время здание храма использовалось как склад на территории военного предприятия. В 1992 году в храме были возобновлены богослужения, установлен новый иконостас и постепенно восстановлены все пять глав, что вернуло храму его первоначальный облик.