Для строительства было выбрано наиболее возвышенное место в центре села.После завершения строительства храм был обнесён высоким каменным забором.
Со второй половины XIX века храм стал центром распространения грамотности в селе. По данным 1859 года, из 1380 жителей Зайцевки грамотными были только 68 человек. В 1896 году при храме начала функционировать церковно-приходская школа, где основным предметом был «Закон Божий». В первый год работы школы в ней обучались 26 учеников. К 1901 году количество учащихся увеличилось до 125 человек, распределённых по трём классам: в первом классе — 50 учеников, во втором — 40, в третьем — 35. В начале XX века приход храма насчитывал более 3000 человек.
В 1930-х годах храм был закрыт. Летом 1931 года с храма были сняты колокола, которые затем вывезли в неизвестном направлении. Здание храма использовалось под склады, мастерские и место для хранения различного имущества. Со временем стены и купола храма обветшали, фрески были утрачены, кресты с куполов были сорваны.
В 2000 году сельскохозяйственная артель «Зайцевская» инициировала работы по восстановлению храма. В 2002 году были установлены новые купола и кресты из нержавеющей стали, частично обновлён фасад здания. После смерти руководителя артели восстановительные работы приостановились.
В 2014 году восстановительные работы были возобновлены. Местные жители активно поддержали инициативу по возрождению храма и приняли участие в работах. В 2016 году восстановление храма было завершено, и он был вновь освящён.
