В 1892 году на церковной усадебной земле был построен деревянный дом, обложенный кирпичом, предназначенный для проживания священника. Этот дом являлся собственностью церкви. 17 января 1893 года при храме открылась церковно-приходская школа для девочек, в которой к 1914 году обучалось 48 учениц. В «Донских епархиальных ведомостях» за 1898 год отмечалось: «В Латонской одноклассной церковно-приходской школе девочек учили рукоделию».
К 1914 году в штате церкви состояли священник и псаломщик, назначенные распоряжением Донского Епархиального Начальства. Жалованье им не выплачивалось, однако утварью храм был обеспечен в достаточной мере. Кружечные доходы за 1914 год составили 1249 рублей 80 копеек. Земельные владения церкви включали 900 квадратных саженей усадебной земли вместе с церковным погостом, включая участок под домом священника, а также 625 квадратных саженей под зданиями церковно-приходских школ. Дом священника и здания школ находились в хорошем состоянии, тогда как дом псаломщика требовал ремонта. Расстояние от церкви до Консистории составляло 114 верст, до местного благочинного в слободе Федоровке — 25 верст, до слободы Матвеев-Курган — 18 верст.
В 1915 году был построен новый храм из белого кирпича с высокой колокольней, на которую вела железная лестница. Освящение храма состоялось в 1918 году.
С 1922 года в округе началась кампания по изъятию церковных ценностей. В 1930-х годах коллективизация привела к использованию храмов в качестве зернохранилищ, что в конечном итоге приводило к их закрытию. Сельсовет договаривался с общиной о временной сдаче части храма под хранение зерна на несколько месяцев. После истечения срока власти не освобождали храм, объясняя это нехваткой помещений, и занимали еще большую площадь, впоследствии полностью используя здание под зернохранилище. Община либо переходила в подцерковный дом, либо прекращала свое существование. После освобождения здания от зерна оно оказывалось в непригодном состоянии, а отсутствие юридических прав у общины не позволяло проводить ремонт. В результате договор об аренде расторгался, и храм закрывался. В слободе Латоны произошла аналогичная ситуация. В 1935 году церковное общество слободы Латона в жалобе сообщало: «Когда насыпали зерно, по распоряжению Совета, северный алтарь засыпали зерном. От этого на иконостасе, на иконах подавили много стекла…».
В 1937 году церковь была разрушена, однако богослужения продолжались в подцерковном доме до 1959 года, после чего здание передали школе под мастерские, и церковь была полностью закрыта.