Приход храма в честь святой мученицы Лидии был образован 2 марта 2008 года. В ноябре 2009 года началось возведение временного храмового сооружения, что позволило начать регулярные богослужения. Храм посвящен раннехристианской святой Лидии Иллирийской, пострадавшей за веру во II веке.
Исторических данных о более ранних храмах или часовнях на этом месте не обнаружено. Участок расположен в районе новой жилой застройки города Благовещенска. Архитектурное решение храма выполнено в традициях православного зодчества с элементами современного храмостроительства.
Престольный праздник храма отмечается 5 апреля (23 марта по старому стилю) в день памяти святой мученицы Лидии. В храме совершаются все положенные богослужения суточного круга. При храме действует воскресная школа и библиотека православной литературы.
С 2013 года приход ведет активную миссионерскую и социальную деятельность. Регулярно организуются паломнические поездки по святым местам Дальнего Востока. Храм поддерживает связи с другими приходами Благовещенской епархии.