Первые обсуждения о строительстве начались в 1996 году, когда жители поселка обратились к местным властям и духовенству с просьбой о выделении земли под храм. В 1997 году соответствующий участок на улице Главной, 24/1, был официально передан церковному приходу. Средства на строительство собирались за счет добровольных пожертвований местных жителей, а также за счет помощи меценатов, многие из которых пожелали остаться анонимными. К 1998 году был подготовлен проект храма, выполненный в традиционном русском стиле, с использованием архитектурных решений, характерных для южного региона России.
Возведение храма началось в 1999 году.. Основной материалом для строительства стал кирпич, а крышу было решено покрыть металлочерепицей. Архитектурный облик храма включает в себя типичный для православных церквей купол, венчаемый крестом, а также простые, но изящные декоративные элементы. Интерьер изначально планировался строгим и лаконичным, что соответствовало каноническим требованиям Русской Православной Церкви.
Значительное внимание уделялось внутреннему убранству. Иконостас, изготовленный местными мастерами, был установлен в 2002 году. В тот же период были написаны первые иконы для храма, которые разместили в специально подготовленных киотах. Все работы велись под строгим контролем представителей церковных властей, что обеспечило точное соблюдение всех канонов и правил.
Официальное освящение храма состоялось в 2003 году. Этот год стал важной вехой в истории прихода, поскольку с этого момента начались регулярные богослужения и церковные обряды. Храм стал не только духовным центром поселка Водники, но и местом, где проводились культурно-просветительские мероприятия. При храме была организована воскресная школа для детей и взрослых, в которой велась катехизация, изучение Священного Писания и основ церковного пения.
В последующие годы храм претерпел несколько реконструкций. В 2008 году была проведена первая крупная реставрация: заменены кровля и окна, обновлен фасад, улучшена система отопления. В 2012 году появилась новая звонница, на которую были подняты несколько колоколов, изготовленных на одном из российских литейных заводов. К 2015 году было завершено благоустройство прилегающей территории, включая устройство пешеходных дорожек, посадку деревьев и кустарников.
На протяжении своего существования храм св. кн. Владимира неоднократно становился центром религиозной и общественной жизни поселка. Здесь проводились праздничные литургии, крестные ходы, благотворительные акции, а также мероприятия, посвященные значимым историческим датам. Храм принимал паломников из разных регионов России, что способствовало укреплению связей между приходами и развитию местной православной культуры. В настоящее время приход поддерживает традиции, заложенные при его основании, уделяя большое внимание образовательной и благотворительной деятельности. Сохраняя свою архитектурную идентичность, храм остается важным объектом культурного наследия и символом возрождения церковной жизни в Краснодарском крае.
