Храм во имя святителя Иннокентия Иркутского в городе Братске был образован в 2006 году после передачи здания по улице Макаренко, 22 православной общине города. Решение о передаче было принято городской администрацией по ходатайству Свято-Успенского прихода. Здание первоначально требовало значительных работ по благоустройству.
Первое богослужение в молельной комнате храма состоялось 7 апреля 2007 года, в праздник Благовещения Пресвятой Богородицы. 21 октября 2007 года часовня была торжественно освящена архиерейским чином. В декабре 2010 года завершилась пристройка алтаря, что позволило с 7 января 2011 года совершать в храме Божественную литургию.
Архитектурное решение храма соответствует традициям православного зодчества. В 2011 году был установлен иконостас, изготовленный иконописцами из Волгодонска. В октябре того же года в храме появился киот с иконой святителя Николая Чудотворца. 28 октября 2011 года на храме были установлены маковка и крест над алтарной частью.
При храме действуют воскресная школа, военно-патриотический центр «Ладья» и казачий кадетский класс. Центр «Ладья» организует военно-полевые сборы и участвует в проведении православных праздников. С 2012 года при храме работает группа социальной помощи, занимающаяся поддержкой малоимущих семей и детей-сирот.
Исторически храм связан с памятью святителя Иннокентия (Кульчицкого), первого епископа Иркутского, прославленного в лике святых в XVIII веке. Мощи святителя, утраченные в советский период, были возвращены в Иркутск в 1990 году после их обнаружения в Ярославском музее атеизма.