Храм преподобного Серафима Саровского в поселке Шишино был основан в 1921 году. В период с 1921 по 1940 год в деревне действовала церковь. 5 ноября 1937 года последние священнослужители храма — протоиерей Давид Фомич Боровик (1867 г.р.) и диакон Николай Михайлович Мерцалов (1902 г.р.) — были расстреляны. В начале 1950-х годов здание храма было разобрано. На его месте 1 августа 2006 года установлен Поклонный Крест.
Возобновление прихода произошло в 1992 году. Первым настоятелем стал иерей Петр Гордиенко, оборудовавший под храм небольшой деревянный дом. С 1994 года настоятелями поочередно служили священники Александр Кудристенко, иеромонах Нифонт и Павел Баранов. В 1997 году на средства отца Павла был приобретен и переоборудован под храм кирпичный дом в центре поселка.
С 1999 года в храме проводились ремонтные работы: была перекрыта кровля, установлен новый купол, территория обнесена кирпичной оградой. В 2005 году на пожертвования прихожан приобретен комплект из семи колоколов. В 2006 году начато строительство кирпичной колокольни, завершенное в 2009 году. Также в этот период велось строительство примыкающих к храму зданий воскресной школы, православного магазина и библиотеки.
Осенью 2009 года в храме установлен деревянный резной иконостас. Среди святынь храма — частица мощей преподобного Серафима Саровского, а также частицы мощей преподобных и блаженных жен Дивеевских и святых мучениц Евдокии, Дарии и Марии Суворовских. С 2000 года при храме действует воскресная школа, имеется библиотека.