В 1964 году, в период антирелигиозной политики, единственный на тот момент в Анапе храм Онуфрия Великого был закрыт. Местная православная община, стремясь сохранить духовную жизнь, организовала сбор средств, на которые был приобретён жилой дом на улице Гребенской. В этом здании был устроен молитвенный дом, освящённый в честь святого Онуфрия Великого, который на протяжении почти трёх десятилетий оставался единственным действующим храмом в Анапском районе.
В 1991 году, после возвращения верующим здания Свято-Онуфриевского храма, церковь на улице Гребенской была переосвящена 21 июля 1992 года в честь преподобного Серафима Саровского.
В декабре 2005 года началось строительство нового храма во имя Серафима Саровского на улице Маяковского. Архитектурный проект был выполнен в традициях псковско-новгородского зодчества XII—XIV веков, что отразилось в характерных формах и элементах здания. К 2014 году основные строительные работы были завершены.
Первое богослужение в новом храме состоялось 7 января 2014 года, в праздник Рождества Христова. С этого момента храм начал полноценную богослужебную деятельность. 12 марта 2014 года, в связи с открытием нового храма на улице Маяковского, церковь на улице Гребенской была переосвящена в честь иконы Божией Матери «Умиление».
При храме функционируют православная библиотека имени святых Кирилла и Мефодия, воскресная школа для детей и взрослых, а также православное молодёжное объединение «Круг». Активно действует приходская служба милосердия, включающая волонтёрский корпус по уходу за немощными на дому, склад вещевой помощи «Каритас», центр поддержки семьи и материнства, а также предоставляются медицинские, психологические и юридические консультации для нуждающихся. Завершается строительство и оснащение Дома Милосердия — социального приюта полного пансиона для одиноких немощных граждан.
