Храм Рождества Пресвятой Богородицы в станице Вышестеблиевской относится к числу православных церквей, построенных в период активного освоения Кубани. Станица Вышестеблиевская основана в 1794 году как одно из казачьих поселений, что позволяет предположить, что храм мог быть возведен в конце XVIII или начале XIX века, хотя точная дата постройки не установлена. Архитектурный стиль храма характерен для культовых сооружений юга России того периода.
В дореволюционный период храм входил в состав Екатеринодарской епархии. Как и многие церкви в казачьих станицах, он выполнял не только религиозные, но и социальные функции, являясь центром общественной жизни. В метрических книгах XIX века сохранились записи о крещениях, венчаниях и отпеваниях, совершавшихся в храме.
В советский период храм, как и большинство культовых сооружений, был закрыт. Здание использовалось для хозяйственных нужд, что привело к утрате части внутреннего убранства. Религиозная деятельность возобновилась в 1990-х годах после передачи здания Русской Православной Церкви. Реставрационные работы проводились силами прихожан и местной общины.
Архитектура храма представляет собой традиционный для кубанских станиц трехчастный объем: алтарь, основное помещение и притвор. Колокольня, характерная для многих казачьих храмов, была воссоздана в ходе реставрации. В интерьере сохранились фрагменты настенной росписи, датируемой концом XIX века.