Первая деревянная церковь во имя Рождества Пресвятой Богородицы в селе Хотьково была построена в 1900 году на средства прихожан и других жертвователей. Храм возводился в одной связи с колокольней на каменном фундаменте. При церкви действовала библиотека. В июне 1930 года был арестован и приговорён к пяти годам лишения свободы уроженец села, священник Михаил Семёнович Розанов, служивший настоятелем с момента постройки храма.
После ареста отца Михаила в храме служил вернувшийся из ссылки священник храма Воскресения Христова села Усты Иоанн Соколов, который в 1937 году был арестован и расстрелян 2 ноября того же года. По воспоминаниям жителей села, богослужения в храме продолжались - в нём служили странствующие из прихода в приход священники. В 1939 году храм был разрушен.
В 2001 году на месте разрушенной церкви началось строительство нового каменного храма по проекту екатеринбургского архитектора Анисимова. Строительство велось попечением уроженца села Павла Николаевича Завального. К Пасхе 2002 года строительство храма с внутренней отделкой было завершено. 25 мая 2002 года архиепископ Калужский и Боровский Климент совершил освящение престола во имя Рождества Пресвятой Богородицы. С этого дня в храме совершаются регулярные богослужения.
Храм является Архиерейским подворьем. В 2015 году в храме проводились реставрационные работы. При храме действует воскресная школа, открытая 1 сентября 2002 года. Село Хотьково образовалось предположительно в первой половине XVI века после устройства Сенецкой засеки. В Засечной книге 1638 года оно упоминается в описании Кцынской засеки.