Согласно историческим данным, первая церковь в селе Душкино упоминается с 1609 года. Первоначально это был деревянный храм с одним престолом, увенчанный тремя куполами. В 1808 году сильная буря повредила здание, сорвав две главы. В результате храм был перестроен: убраны оставшиеся главы, а отдельно от здания возведена колокольня. В 1858 году фундамент храма заменили на каменный, а колокольня была соединена с основным зданием.
В 1891 году на месте старой церкви был возведен новый деревянный храм, сохранившийся до наших дней. Здание представляет собой характерный для Брянщины того периода деревянный храм с традиционной крестообразной объемной композицией. К основному четверику примыкают пятигранная апсида с пониженными прирубами дьяконника и жертвенника, боковые рукава и трапезная с более узкой папертью. Фасады украшены навесами крылец на фигурных столбиках с резными фронтонами, что придает зданию особую выразительность.
После событий 1917 года храм претерпел изменения: были разобраны завершение храма и колокольня. Во время ремонта в 1940 году завершение храма было восстановлено, однако колокольня не была воссоздана. С 1937 по 1942 годы храм не функционировал; здание использовалось как зернохранилище. В послевоенные годы храм продолжил свою деятельность и не закрывался.
