Строительство храма началось в 2009 году по благословению архиепископа Ярославского и Ростовского Кирилла (Наконечного). Памятный крест на месте будущего храма был освящён архимандритом Вениамином (Лихомановым), впоследствии епископом Рыбинским и Романово-Борисоглебским.
С 2011 года, в день празднования Рождества Иоанна Предтечи (7 июля), в стенах строящегося храма проводились богослужения, собирающие значительное число верующих. 10 ноября 2013 года храм был освящён митрополитом Кириллом (Наконечным) в сослужении епископа Вениамина. После освящения многие прихожане и благотворители, участвовавшие в строительстве, были отмечены церковными наградами и благодарственными письмами.
В декабре 2024 года храм Рождества Иоанна Предтечи был оснащён архитектурной подсветкой в рамках регионального проекта по украшению знаковых зданий и объектов. Ранее подобная подсветка была установлена на районном культурно-досуговом центре села Брейтово.