Село Пыркино, первоначально известное как Пыркинская слобода, было основано в 1660-х годах конными казаками. В 1688 году в слободе уже существовала церковь, при которой служил священник Викул Иванов. В 1701 году был выдан антиминс для новопостроенной церкви Архистратига Михаила, где служил священник Иван Иванов. После перевода служилых людей в Азов в 1697 году земли слободы перешли во владение князей Голицыных. В 1715 году, когда вотчиной владели князья Дмитрий Михайлович и Михаил Михайлович Голицыны, к церкви Михаила Архангела был переведен священник Василий Иванов.
К началу XIX века деревянные храмы в селе пришли в ветхость. В 1820 году, по инициативе и на средства статского советника Михаила Адриановича Устинова, началось строительство каменного храма во имя Рождества Христова с приделом во имя Архистратига Михаила. Строительство было завершено в 1830 году, и храм был освящен. Архитектурно здание выполнено в стиле классицизм: двухсветный четверик увенчан большой ротондой, покрытой куполом; с восточной стороны примыкает полукруглая апсида, с западной — трапезная. Северный и южный фасады ранее завершались треугольными фронтонами, следы которых сохранились до настоящего времени.
В 1915 году в храме были установлены двери в арке, разделявшей основное помещение и теплый придел; двери были украшены священными изображениями. Вокруг церкви была устроена чугунная ограда. Каменные дома причта также были построены за счет Михаила Адриановича Устинова. К церкви была приписана деревянная часовня на кладбище в деревне Еланке, а также приписная деревянная часовня на Пыркинском винокуренном заводе, в которой находилась чтимая икона святой мученицы Параскевы.
В 1931 году храм был закрыт и использовался как складское помещение. Колокольня храма была частично разрушена, сохранился только первый ярус. В 2000 году началось восстановление храма: был установлен временный деревянный крест на куполе. С 2004 года в храме регулярно проводятся богослужения. Левый придел в трапезной части храма был освящен во имя великомученицы Параскевы, где помещен ее образ, вернувшийся в село после возрождения храма.
В пяти километрах от села, в лесном овраге, находится святой источник великомученицы Параскевы Пятницы. По преданию, более ста лет назад на этом месте явился ее образ. Помещик Устинов построил на этом месте каменную часовню. Ежегодно, в десятую пятницу после Пасхи, от храма к источнику совершается крестный ход. В советское время часовня была разрушена, но в начале 2000-х годов восстановлена, и традиция крестных ходов возобновлена.