Строительство храма было инициировано в 1782 году генерал-поручиком Никитой Афанасьевичем Бекетовым, бывшим астраханским губернатором. Храм был возведён в его поместье Отрада и освящён в 1795 году в честь святого покровителя Бекетова — преподобного Никиты Исповедника. Здание выполнено в стиле зрелого классицизма. Кирпичная церковь с небольшой трапезной была построена из кирпича, произведённого на специально созданном для этого заводе в поместье. Деревянными оставались только колокольня и барабан с куполом. Особенностью храма является расположение купола непосредственно над алтарной частью, что нетипично для русской архитектуры того времени.
В 1867 году храм был отремонтирован, при этом деревянные элементы заменили на каменные: колокольня стала каменной, были пристроены притворы с севера и юга. В притворах сохранились голландские печи и кованые решётки на окнах.
После революции 1917 года храм продолжал функционировать, однако в 1940 году был закрыт, а здание передано под культурно-просветительское учреждение. В период Сталинградской битвы на колокольне храма был устроен наблюдательный пункт, а в самом здании располагался командный пункт 157-й стрелковой дивизии. В июне 1943 года, по просьбе верующих, храм был вновь открыт и продолжает действовать по настоящее время.