Храм преподобного Макария Римлянина находится на территории бывшей Макарьевской Успенской пустыни, основанной в середине XVI века. Преподобный Макарий, уроженец Рима, прибыл в Новгородские земли, принял монашество в Свирском монастыре и позднее поселился в уединении на берегу реки Лезны. Здесь им была построена деревянная церковь в честь Успения Пресвятой Богородицы, вокруг которой образовалась монашеская община.
В 1611 и 1615 годах монастырь был разорён шведскими войсками, но впоследствии восстановлен. В 1764 году обитель была упразднена в ходе секуляризационной реформы, а Успенская церковь обращена в приходскую. В 1761 году над захоронением преподобного Макария был устроен придел. В 1840 году на месте обветшавшего храма возвели новую деревянную церковь с колокольней, а над мощами святого установили резную позолоченную раку.
В 1894 году монастырь был возобновлён как Воскресенский миссионерский монастырь. В 1901 году в Успенском храме устроены приделы во имя апостолов Петра и Павла, а также преподобных Антония Великого и Макария Римлянина. В 1915 году освящён каменный храм во имя архангела Михаила. Монастырь владел подворьями на станциях Любань и Малая Вишера.
В 1932 году обитель была закрыта, братия репрессирована. В послевоенные годы монастырские строения пришли в запустение. В 2005 году началось возрождение пустыни как скита Тихвинского Успенского монастыря. На месте погребения преподобного Макария сохраняются почитаемые святыни, включая частицу Животворящего Креста Господня и камень от Гроба Господня, переданные Иерусалимским Патриархом Дамианом в 1900 году.