История церкви насчитывает несколько столетий и отражает развитие религиозной и общественной жизни села.
Село Вожгалы было основано 19 марта 1670 года по благословению Московского Патриаршего приказа. В 1672 году в селе была построена первая деревянная церковь во имя святых апостолов Петра и Павла. К 1727 году погост Вожгальский значился как архиерейская вотчина, а в 1728 году на месте прежней деревянной церкви был возведён каменный двухпрестольный храм: холодный в честь Покрова Пресвятой Богородицы и тёплый во имя святых апостолов Петра и Павла.
В 1798 году началась перестройка тёплого храма, завершившаяся в 1814 году. В результате были устроены два придела: Петропавловский, освящённый 16 марта 1814 года, и в честь святителя Василия Великого Кесарийского. В 1833 году, ввиду тесноты, холодный храм был разобран, и на его месте заложен новый, более просторный. Строительство продолжалось восемь лет, и 28 сентября 1841 года главный престол был освящён во имя Преображения Господня. Дополнительно, 17 и 18 июня 1844 года были освящены северный придел в честь Покрова Пресвятой Богородицы и южный — во имя святых апостолов Петра и Павла соответственно.
В 1859 году тёплая церковь была расширена, что позволило увеличить её вместимость и улучшить условия для проведения богослужений в холодное время года. На приходском кладбище в 1857 году была построена каменная Воскресенская церковь с одним престолом в честь Воскресения Господня. Её строительство началось по храмозданной грамоте от 26 февраля 1846 года и завершилось освящением 1 декабря 1857 года.
К началу XX века Преображенская церковь представляла собой двухэтажное каменное здание с тремя престолами в верхнем храме: главным во имя Преображения Господня, северным в честь Покрова Пресвятой Богородицы и южным во имя святых апостолов Петра и Павла. В нижнем храме находились престолы в честь святителя Василия Великого и святых мучеников Гурия, Самона и Авива. Приход состоял из 80 селений с населением более 9 тысяч человек. В селе функционировали земская больница, волостное правление, а также несколько школ: двухклассная министерская мужская, земская женская и церковно-приходская.