В 1696 году в Пидьме была возведена первая деревянная Преображенская церковь. Этот храм отличался архитектурными особенностями, характерными для шатровых церквей того периода, включая восьмерик, начинающийся от земли. В XVIII веке в церкви был освящён придел во имя преподобного Варлаама Хутынского, который к концу XIX века был упразднён.
В 1830 году, в связи с ростом населения и потребностью в более вместительном храме, была построена каменная церковь Преображения Господня. Архитектурный стиль нового здания соответствовал канонам классицизма, распространённого в тот период. В 1862 году церковь подверглась перестройке, в результате которой были добавлены приделы во имя преподобных Варлаама Хутынского и Александра Свирского.
Согласно данным 1873 года, село Пидьма имело три православные церкви и две часовни.
В 1937 году, в период антирелигиозной политики Советского Союза, каменная Преображенская церковь была закрыта, и её здание использовалось для различных хозяйственных нужд. Во время Великой Отечественной войны, в 1942 году, деревянная церковь 1696 года постройки была уничтожена в результате боевых действий.
В 1990-х годах начались работы по восстановлению каменной Преображенской церкви. Однако в начале 2000-х годов, после пожара, восстановительные работы были приостановлены. В 2007 году возобновилось восстановление храма, и к 2009 году внешние работы были завершены, включая позолоту куполов и шпиля колокольни.
