Храм Преображения Господня в Геленджике был основан как кладбищенская часовня в 1909 году на территории городского кладбища, освященного в 1904 году. Первоначально в часовне совершались только отпевания и панихиды. В 1952 году, после закрытия Вознесенского собора в центре Геленджика, часовня стала использоваться для регулярных богослужений общиной перенесенного храма. В этот период был перенесен престол, иконостас и церковная утварь из закрытого собора.
В 1990-х годах началась реконструкция часовни в храмовый комплекс. В 1993 году расширенное основное помещение было освящено в честь Преображения Господня. В 1996 году к храму была пристроена колокольня с притвором по проекту архитекторов С.В. Беребердина и С.Я. Кузнецова. В 2002 году на территории построено двухэтажное здание с крестильной комнатой и классами воскресной школы. В 2008 году возведена часовня святителя Николая Чудотворца в память о трагически погибших жителях Геленджика.
Архитектурно храм представляет собой крестообразное в плане здание с одноглавым завершением на глухом барабане. Колокольня двухъярусная, с шатровым завершением. Фасады выдержаны в бело-коричневой цветовой гамме. На стенах храма и воскресной школы размещены мозаичные иконы.
Среди святынь храма особо почитается икона Божией Матери «Троеручица» и ковчег с частицами мощей numerous святых, включая преподобных Соловецких, великомученика Пантелеимона, святителя Луки Войно-Ясенецкого и других.