Первое упоминание о селе Проходное датируется XVII веком. Согласно данным Статистического комитета на 1862 год, в селе уже действовала православная церковь во имя Покрова Пресвятой Богородицы. Это свидетельствует о наличии церковного прихода и соответствующего статуса населенного пункта. В 1879 году на месте прежнего деревянного храма был возведен новый каменный храм, который стал центром духовной жизни местного населения.
В 1886 году при храме была открыта церковно-приходская школа, где обучались 52 ученика. К 1900 году на средства земства и прихожан было построено новое здание школы. По данным 1909 года, храм регулярно посещали 836 прихожан.
С установлением советской власти началась антирелигиозная кампания, в ходе которой храм был закрыт в конце 1950-х — начале 1960-х годов. Здание подверглось разрушению, однако на его стене сохранилась табличка с надписью: «Памятник архитектуры, Покровский храм, 1879 год. Охраняется государством».
В 2007 году, по инициативе местных жителей и при поддержке депутата Государственной Думы С. В. Муравленко, был освящен закладной камень нового храма. Строительство осуществлялось по проекту белгородского архитектора Л. И. Колесниковой при содействии корочанского филиала ОАО «МРСК Центра» — «Белгородэнерго». Шесть колоколов для звонницы были изготовлены в воронежской мастерской Балясникова.
14 октября 2008 года новый деревянный храм был освящен архиепископом Белгородским и Старооскольским Иоанном. С этого времени храм вновь стал центром духовной жизни села.
