Строительство храма было завершено в 1776 году на средства местного помещика Сергея Семёновича Александрова. Первоначально храм был каменным, трёхпрестольным, с главным алтарём, освящённым в честь Святителя Николая Чудотворца. В 1859 году к основному зданию были пристроены два придела, освящённые в честь Святых равноапостольных Константина и Елены и Святой Великомученицы Варвары. Эти изменения также повлияли на архитектурный облик храма, в частности, на его декоративные элементы.
Архитектурно храм сочетает в себе черты позднего классицизма и эклектики. Основной прямоугольный двусветный объём, ориентированный по оси север-юг, соединён короткой трапезной с трёхъярусной колокольней, пристроенной с западной стороны. Прямоугольная алтарная апсида расширена до линии северного и южного фасадов. В объёмно-пространственной характеристике колокольни и декоре светового барабана прослеживаются черты традиции позднего барокко.
В дореволюционный период храм играл важную роль в духовной жизни местного населения. Приход включал село Паниковец и несколько соседних деревень, общая численность прихожан составляла 2464 души обоего пола. При храме действовали три школы: земская, церковно-приходская и школа грамоты. Причт состоял из священника, диакона и псаломщика. Особо почитаемой святыней храма являлась икона Святителя Николая Чудотворца, пожертвованная строителем храма.
В советский период храм, как и многие другие религиозные учреждения, подвергся закрытию и разорению. Здание использовалось под различные хозяйственные нужды, что привело к его значительному разрушению. Однако в конце XX века начался процесс восстановления храма. Благодаря усилиям местных жителей и духовенства, храм был восстановлен и вновь открыт для богослужений.
В настоящее время храм Покрова Пресвятой Богородицы в селе Паниковец является действующим православным храмом. Он продолжает служить духовным центром для местного населения и привлекает паломников из различных регионов. Храм также известен благодаря иконе Божией Матери «Праворучица», которая является главной святыней храма и почитается верующими.
