Храм Покрова Пресвятой Богородицы в селе Маковское является одним из старейших православных храмов Енисейской епархии. Первая церковь на этом месте была построена в первой четверти XVII века, вскоре после основания Маковского острога в 1618 году. Первое документальное упоминание о храме содержится в записках царского посланника Н. Г. Спафария, посетившего острог в 1675 году.
Деревянная церковь неоднократно страдала от пожаров. В 1757 году храм полностью сгорел, уцелели лишь святые иконы, антиминс и церковная утварь. Новая церковь была построена в 1758 году, но простояла менее 40 лет и вновь уничтожена огнём в 1795 году. Третья по счёту церковь, также деревянная, была освящена в 1798 году.
В 1836 году прихожане обратились с прошением о строительстве нового храма взамен обветшавшего. После длительных проволочек, вызванных недостатком средств, строительство началось лишь в 1862 году. Храм был возведён на новом месте, на восточной окраине села, и освящён 12 июля 1864 года епископом Енисейским и Красноярским Никодимом.
Особенностью архитектуры храма стало использование обожжённых лиственничных брусьев в качестве фундамента. Храм имел один престол во имя Покрова Пресвятой Богородицы, шесть колоколов и достаточное количество утвари. В 1893 году деревянные крыша и купол были заменены на железные.
В 1930 году храм был закрыт, церковное имущество изъято, а здание передано под народный дом. В конце XX века храм был возвращён верующим. В настоящее время богослужения совершаются по субботам, воскресеньям и праздничным дням.