До этого момента жители Эмеково относились к приходу церкви Алексия, человека Божия, в селе Алексеевское Чебоксарского уезда Казанской губернии.Строительство собственного храма способствовало преобразованию деревни Эмеково в статус села.
Архитектурно здание представляет собой деревянную однопрестольную пятиглавую церковь, возведенную на каменном фундаменте. Компоновка включает основной четверик с крыльцами, трапезную и колокольню с шатровым завершением. Внешний декор храма схож с Покровской церковью в селе Чкарино, что может свидетельствовать о работе одной артели плотников-строителей.
В 1930-х годах, в период антирелигиозной политики советского государства, храм был закрыт. Здание использовалось под различные нужды: клуб, производственные мастерские во время Великой Отечественной войны, склад и магазин. В этот период были утрачены верхние объемы здания, включая пятиглавие и колокольню.
В 1997 году здание храма было возвращено Русской Православной Церкви, после чего начались восстановительные работы. Первое богослужение после длительного перерыва состоялось 12 июля 1998 года. В ходе реставрации были сооружены новые центральная и боковые главы, однако они не полностью соответствуют первоначальному архитектурному облику.
