История храма Покрова Пресвятой Богородицы в станице Копанской начинается с основания самой станицы. Решение о переселении жителей Екатеринодарского уезда на место будущей станицы было принято Казачьим Военным Советом 14 июня 1872 года. В апреле 1873 года станица Копанская была заселена. Первоначально богослужения проводились в малом деревянном доме, точная дата начала которых неизвестна.
16 октября 1876 года распоряжением преосвященного Германа, епископа Кавказского и Екатеринодарского, в станицу был направлен священник Илия Кубанский. 1 ноября того же года ему в помощь был назначен псаломщик Пётр Ястребов. 21 января 1877 года было получено разрешение на строительство молитвенного дома в честь Покрова Божией Матери. В течение года одноглавая деревянная церковь была построена и освящена 13 февраля 1878 года, предположительно малым, иерейским чином.
В 1894 году священник Александр Иванович Ефимов совершил чин на основание нового храма на месте нынешнего парка станицы. Станичники построили большой деревянный однопрестольный пятикупольный храм под железной кровлей, на кирпичном основании с кирпичной колокольней. Храм был освящён 30 сентября 1895 года, вероятно, по благословению правящего архиерея иерейским чином. Храм не отапливался зимой, но был богато украшен.
Современный храм Покрова Пресвятой Богородицы в станице Копанской был построен в 1981 году. Первое богослужение совершено 4 декабря 1981 года на праздник Введения во храм Пресвятой Богородицы. Освящение храма архиепископом Краснодарским и Кубанским Владимиром состоялось 21 февраля 1982 года.