Храм Покрова Пресвятой Богородицы в деревне Болотово (ранее погост Знахлицы) впервые упоминается в Псковских писцовых и оброчных книгах 1585–1587 годов. Первоначальное здание предположительно было построено в XVI веке в стиле древнерусского зодчества. В 1896–1898 годах на средства прихожан и благотворителей был пристроен кирпичный придел во имя Преображения Господня, а основной объем храма расширен под руководством гражданского инженера Николая Ильича Богданова. Освящение придела состоялось 20 сентября 1898 года.
В 1912 году в честь 300-летия дома Романовых была перестроена колокольня: вместо прежней звонницы возведена двухъярусная шатровая конструкция с четырьмя колоколами. Главный колокол весил около 13 пудов, второй — 10 пудов, два малых — по 1 пуду. Храм имел два престола: главный — в честь Покрова Пресвятой Богородицы и придельный — Преображения Господня.
В 1805 году приход насчитывал 1755 человек, к 1900 году — 3056. Основными занятиями прихожан были хлебопашество и льноводство. С 1820 года ежегодно совершался крестный ход в память о явлении Богородицы в Чирской церкви в 1420 году, связанном с избавлением Псковской земли от мора. В 1874 году храм участвовал в сборе средств для Ильинской общины сестер милосердия.
В 1937 году был арестован и расстрелян священник Петр Иоаннович, служивший в храме до 1917 года. В 1942 году псковская иконописная мастерская выполнила роспись иконостаса. В советский период храм продолжал действовать, несмотря на гонения. В настоящее время он относится к Псковской епархии Русской Православной Церкви.
На церковном кладбище сохранились захоронения дворянского рода Назимовых, включая могилу владельца деревни Назимово — Г.П. Назимова. В храме находилась местночтимая икона Иисуса Христа XV века, изображающая Спасителя с двуперстным благословением.