Собор Покрова Пресвятой Богородицы в городе Кропоткин был основан как монастырский храм на подворье Кавказского Николаевского миссионерского нештатного общежительного мужского монастыря. Подворье учреждено в 1894 году на территории хутора Романовского (ныне г. Кропоткин) на земле, пожертвованной екатеринодарской мещанкой Евдокией Шульгиной. Строительство каменного собора началось в 1905 году и завершилось в 1913 году. Архитектурный облик храма представляет собой двухъярусный четверик с пятью деревянными световыми восьмериками, увенчанными шлемовидными завершениями. Алтарная часть и западный притвор образованы дополнительными объемами, придающими зданию крестообразную форму. Экстерьер украшен элементами кирпичной кладки: наличниками окон, ширинками, фризами и изображениями греческих крестов.
В 1914 году архиепископ Ставропольский и Екатеринодарский Агафодор (Преображенский) освятил храм в честь Покрова Пресвятой Богородицы. Первоначально собор функционировал как летний храм, тогда как зимние богослужения проводились в отапливаемом Казанском храме, расположенном на территории монастырского подворья. В 1922 году монастырское подворье было закрыто, а в 1929 году прекратились богослужения и в Покровском соборе. Здание использовалось как зернохранилище, а в период Великой Отечественной войны - как склад боеприпасов.
Богослужения в соборе возобновились в 1943 году во время немецкой оккупации города. В послевоенный период началось постепенное восстановление храма. В 1960-х годах проведены работы по возобновлению внутренней росписи, а в 1976 году начата масштабная реставрация, включавшая позолоту иконостаса, восстановление настенных росписей и монтаж системы отопления. В 1990-1991 годах купола храма покрыли медью, а в 1991 году установили новые колокола, отлитые в Воронеже.
Собор имеет три престола: центральный - в честь Покрова Пресвятой Богородицы, правый - в честь Успения Пресвятой Богородицы и левый - во имя святителя Николая Чудотворца. В 1999 году на территории соборного комплекса возведен новый Казанский храм с крестильней и воскресной школой. В 2014 году, к столетию освящения собора, у южного портала установлен памятник святому равноапостольному князю Владимиру и святителю Михаилу, митрополиту Киевскому.