Согласно преданиям, с XVII века в селе Варварское существовал скит Свято-Троицкой Сергиевой лавры. На протяжении длительного времени в селе функционировали два храма: Троицкий и Никоновский. Деревянный Троицкий храм с колокольней был возведен в 1753 году на средства прихожан. В его составе имелись два престола: главный в честь Святой Живоначальной Троицы и придел в трапезной части, посвященный преподобному Сергию Радонежскому. В 1909 году церковный староста Иван Степанович Сухов пожертвовал для украшения Троицкой церкви икону Пресвятой Богородицы «Знамение», новое паникадило и резные Царские врата в алтарь.
Первоначальный Никоновский храм, построенный в XVIII веке, был уничтожен пожаром. В 1899 году на средства церковно-приходского попечительства и добровольных жертвователей был возведен новый деревянный храм во имя преподобного Никона Радонежского. К началу XX века численность прихожан увеличивалась, что обусловило необходимость строительства более просторного каменного храма взамен обветшавшей Троицкой церкви. Незадолго до революции местные крестьяне осуществили этот проект, возведя новый каменный храм.
В 1930-х годах, в период антирелигиозной политики советского государства, храмы села Варварское были закрыты. Деревянная церковь была разрушена, а в здании каменного храма длительное время размещался колхозный склад. С 1960-х годов здание оставалось заброшенным и постепенно приходило в упадок.
Восстановительные работы начались весной 2014 года с расчистки территории храма. 2 апреля того же года был отслужен первый молебен. 1 июня 2014 года митрополит Нижегородский и Арзамасский Георгий посетил восстанавливающийся храм, что подчеркнуло важность данного события для епархии. В апреле 2017 года на храм были установлены малый купол и крест, что стало очередным этапом в процессе реставрации.
Архитектурно храм представляет собой каменное здание, характерное для православных церквей конца XIX — начала XX века. Его конструкция сочетает традиционные элементы русского церковного зодчества с местными строительными особенностями. Восстановление храма осуществляется с учетом сохранения его исторического облика и архитектурных деталей.
