Станица Некрасовская была основана в конце XIX века. Станичники с самого начала уделяли внимание созданию духовного центра. Изначально службы проводились в деревянной хате, расположенной на центральной площади, где позднее планировалось строительство постоянного храма.
В начале XX века, благодаря усилиям местных жителей, началось строительство нового каменного храма в честь Николая Чудотворца. Проект был разработан архитектором из Санкт-Петербурга. Строительство велось на средства, собранные станичниками, и было завершено в 1908 году. Храм был пятикупольным, выполненным из красного кирпича, с просторным залом и тремя входами. Вокруг церкви была установлена чугунная ажурная ограда, а на высокой колокольне разместились пять колоколов, самый большой из которых весил 308 пудов.
В период советской власти церковь была закрыта предположительно в 1937 году. Здание использовалось как склад для хранения зерна, а в 1939 году было разрушено. Колокола были сброшены с колокольни, а стены храма разрушены с помощью взрывчатых веществ. Многие элементы интерьера и экстерьера были утрачены.
В 1991 году, после длительного перерыва, была возобновлена церковная жизнь в станице. Церковная десятка при содействии настоятеля храма преподобного Сергия Радонежского города Усть-Лабинска протоиерея Леонида Черных открыла небольшой храм в честь Николая Чудотворца.
9 января 1996 года состоялось освящение престола храма. Чин освящения был совершен священниками протоиереем Петром Литовченко и протоиереем Александром Шабуниным по благословению митрополита Екатеринодарского и Кубанского Исидора. Здание находилось в муниципальной собственности и было предоставлено сельской администрацией Некрасовского поселения. В 2005 году оно было переоформлено в собственность прихода.
Архитектурное решение современного храма сочетает традиционные элементы русской православной архитектуры. Здание выполнено в стиле, характерном для храмов Краснодарского края, с использованием кирпича и дерева. Особенностью является наличие трёх входов, что облегчает доступ верующих и создает удобство при проведении богослужений.
С момента восстановления храм стал центром духовной жизни станицы Некрасовская. Здесь регулярно проводятся богослужения, крестные ходы и другие церковные мероприятия. Храм также служит местом проведения таинств, таких как крещение, венчание и отпевание.