Первое религиозное сооружение в станице Выселки (ранее хутор Воровсколесский) было построено в 1895 году как молитвенный дом во имя Рождества Пресвятой Богородицы. Здание было деревянным, с одним престолом, без ограды, с колоколами на столбах. В 1897 году на его месте возвели деревянный храм с тем же посвящением, освященный 6 октября 1897 года.
В 1904 году церковь сгорела, и к февралю 1905 года был построен новый деревянный храм, обложенный кирпичом, с кирпичной колокольней в первом ярусе. Стоимость сооружения составила 25 000 рублей. Храм продолжал носить имя Рождества Пресвятой Богородицы.
В 1915 году приход возглавил священник, ранее служивший в селе Братском. В клировых ведомостях отмечается, что к церкви станицы Выселки была временно приписана церковь станицы Новосуворовской. Деятельность прихода прекратилась после 1918 года.
Современный Свято-Никольский храм в станице Выселки относится к Выселковскому благочинию Тихорецкой епархии. Главный престол освящен в честь святителя Николая Чудотворца, нижний придел - в честь Иверской иконы Божией Матери. При храме находится источник Казанской иконы Божией Матери, связанный с историей Николаевского православного миссионерского монастыря, закрытого в 1931 году.