Он является действующим православным храмом, относящимся к Ставропольской и Невинномысской епархии Русской Православной Церкви.
В конце 1980-х годов, в период ослабления государственного контроля над религиозной жизнью, в станице Барсуковская была организована временная церковь во имя святителя Николая Чудотворца. Богослужения проводились в здании советской постройки, переоборудованном под храм. Точная дата начала использования этого здания под церковные нужды неизвестна, но приблизительно относится к 1988–1990 годам.
15 июня 2000 года была официально зарегистрирована местная религиозная организация православного прихода храма святителя Николая Чудотворца станицы Барсуковская. Организация получила статус юридического лица и была внесена в Единый государственный реестр юридических лиц.
В период между 2008 и 2023 годами было начато строительство нового храма во имя святителя Николая Чудотворца. Новый храм был возведён рядом с временным зданием и стал основным местом проведения богослужений. Архитектурные особенности нового храма включают традиционные элементы православного храмового зодчества.