Село Морачёво, известное с XVII века, первоначально являлось поместьем рода Безобразовых. В 1697 году в селе была построена первая церковь во имя святителя Николая Чудотворца, что способствовало преобразованию деревни в село. Эта деревянная церковь служила местным жителям на протяжении более полутора веков.
В период с 1849 по 1850 годы, на средства прихожан и местных благотворителей, была возведена новая каменная церковь, заменившая старую деревянную. Архитектурные особенности нового храма соответствовали канонам православного зодчества того времени, однако детальные описания его внешнего облика и внутреннего убранства в доступных источниках отсутствуют.
После революционных событий 1917 года и последовавшей за ними политики государства в отношении религии, храм был закрыт. В последующие десятилетия здание церкви подверглось разрушению и к настоящему времени не сохранилось.