Село Елизарьево было основано во второй половине XVI века Елизарьем Даниловичем Мальцовым и впервые упоминается в 1612 году. В этот период в селе существовала деревянная церковь, посвященная святителю Николаю Чудотворцу, которая служила духовным центром для местных жителей.
К началу XIX века деревянный храм пришел в ветхость, что обусловило необходимость строительства нового, более долговечного здания. В 1820 году, по инициативе и на средства помещицы графини Толстой, была возведена каменная однопрестольная церковь в стиле классицизма, посвященная святителю Николаю Чудотворцу. Архитектурный облик храма характеризуется строгими линиями и симметрией, присущими классицизму, с элементами, отражающими традиции русского церковного зодчества того времени.
С 1914 года до закрытия храма в 1937 году настоятелем церкви был протоиерей Иаков Гусев, впоследствии канонизированный как священномученик. В 1937 году, в период антирелигиозной политики советской власти, храм был закрыт, а его здание использовалось для различных хозяйственных нужд, что привело к утрате многих элементов внутреннего убранства и ухудшению общего состояния сооружения.
В постсоветский период, с изменением государственной политики в отношении религии, начался процесс возвращения храмов Русской Православной Церкви и их восстановления. В настоящее время храм Николая Чудотворца в селе Елизарьево действует и является центром духовной жизни местного населения. Здание храма восстановлено, и в нем регулярно проводятся богослужения.
