Первое упоминание о храме во имя святителя Николая Чудотворца в селе Стрелецкие Выселки относится к 1676 году, согласно окладным книгам. Однако косвенные свидетельства указывают на возможное существование церкви уже в 1626 году, когда здесь служил священник Иоанн Федоров. Первоначальный храм имел главную икону Николая Чудотворца в золотом окладе, расположенную справа от Царских Врат, а в алтаре находился образ Пресвятой Богородицы. Рядом с церковью располагалась звонница с двумя колоколами.
В 1791 году на месте старой церкви была построена новая деревянная. Строительство каменного храма началось в 1871 году на средства прихожан и завершилось в 1883 году. Церковь была освящена 22 августа 1883 года. Здание выполнено в русском стиле с элементами эклектики, с двусветным четвериком, декоративным пятиглавием и двухпридельной трапезной. Колокольня четырехъярусная, шатровая. Храм и колокольня были покрыты железом и окрашены медянкой.
Главный престол освящен во имя святителя Николая Чудотворца, второй придел — во имя Рождества Пресвятой Богородицы. Позднее в храме появился третий престол — в честь Грузинской иконы Божией Матери. В 1915 году законоучителем в местной земской школе служил священник Михаил Иванович Милосердин.
В 1930-х годах храм был закрыт, как и многие другие церкви того периода, без формального решения властей. Богослужения возобновились в 1989 году после возвращения здания верующим и проведения ремонтных работ. В настоящее время храм действует, богослужения совершаются регулярно.