В 1888 году в поселке Султановском (ныне Минеральные Воды) был открыт православный приход. Изначально богослужения проводились в приспособленном помещении старой лавки. В ответ на просьбы железнодорожных служащих о строительстве полноценного храма Владикавказская железная дорога безвозмездно выделила участок земли площадью 1800 квадратных саженей для возведения церкви и школы. К 1900 году на этом участке была построена церковь Покрова Пресвятой Богородицы с колокольней, а также церковно-приходская школа.
В 1937 году, в период антирелигиозной политики советской власти, здание церкви было разобрано. Священнослужители продолжали проводить богослужения в церковной сторожке, однако впоследствии и это здание было уничтожено.
В 1944 году семья Федоренко пожертвовала участок земли на улице Свободы для строительства нового храма. На этом месте был совершен крестный ход и установлен крест, символизирующий начало строительства. 3 сентября 1950 года построенная церковь была освящена в честь Покрова Пресвятой Богородицы.
19 ноября 1997 года, после завершения строительства нового собора Покрова Пресвятой Богородицы в Минеральных Водах, по благословению митрополита Ставропольского и Владикавказского Гедеона, храм на улице Свободы был переосвящен во имя святителя Николая Чудотворца.
В 2003 году на территории храма была построена новая колокольня, украшенная новыми колоколами.
Архитектурно храм представляет собой кирпичное здание с упрощенными внешними формами, включающее колокольню и окруженное кирпичной оградой.
К святыням храма относится древняя икона Божией Матери «Скоропослушница», написанная на горе Афон.
При храме функционирует воскресная школа, занятия в которой проводятся по воскресеньям в 11:00.
