Село Минеральные Воды, основанное в 1786 году, с развитием приобрело статус города в 1925 году. В начале XX века, учитывая рост населения и потребность в новых местах для богослужений, возникла необходимость строительства дополнительного храма. В 1910 году на месте деревянной церкви был заложен каменный храм в честь Царственных Страстотерпцев. Строительство велось на средства местных жителей и благотворителей.
Архитектурный проект храма был разработан в традициях русской православной архитектуры. Здание представляло собой однонефный храм с трапезной и колокольней. Фасады были украшены пилястрами и арочными окнами, что придавало сооружению строгость и величие.
После Октябрьской революции 1917 года и установления советской власти храм, как и многие другие религиозные учреждения, подвергся репрессиям. В 1920-е годы здание было закрыто, а в 1930-е годы использовалось для хозяйственных нужд.
В годы Великой Отечественной войны храм был восстановлен и вновь начал функционировать. В послевоенный период проводились реставрационные работы, направленные на сохранение исторического облика здания и улучшение внутреннего убранства.
В 1990-е годы, с возрождением религиозной активности, храм Царственных Страстотерпцев стал центром духовной жизни города. Были проведены значительные работы по восстановлению и благоустройству территории. Внутри храма был установлен новый иконостас, выполненный в традиционном стиле, а также обновлены витражи и освещение.