Село Казачья Лисица было основано в 1643 году. В 1780 году в селе был построен деревянный храм в честь Казанской иконы Божией Матери. В 1834 году, в связи с увеличением числа прихожан, храм был расширен: к основному зданию пристроили два крыла, образовав северный и южный приделы. Северный придел предназначался для казаков, проживавших на правом берегу реки Лисёнок, а южный — для дворян, обитавших на левом берегу. В 1907 году храм был вновь перестроен.
В период коллективизации, характерной для 1930-х годов, храм был закрыт, его имущество конфисковано, а здание использовалось для различных хозяйственных нужд. Во время Великой Отечественной войны, в период оккупации села немецкими войсками, храм был вновь открыт для богослужений. После окончания войны храм продолжил функционировать и остается действующим по сей день.