Село Богородское, ранее носившее название Коткишево и Беберино, расположено на берегу реки Ветлуги. Первое упоминание о храме в этом селе относится ко второй половине XVII века. В 1672 году в списках церквей Поветлужья упоминается храм Явления иконы Пресвятой Богородицы Казанская в вотчине стольника Степана княжьего сына Ивана Татаева в селе Беберино. Первоначально храм был деревянным, построенным в клетском стиле, характерном для церковной архитектуры того периода.
В 1745 году на месте старого деревянного храма был построен новый деревянный храм во имя Иоанна Предтечи. В начале XIX века приход села Коткишева составляли крепостные крестьяне вотчины майора Петра Александровича Собакина. В 1816 году началось строительство каменной церкви во имя Казанской иконы Божией Матери, которое велось «тщанием прихожан». Автор проекта не установлен, но предполагается, что к возведению храма мог иметь отношение нижегородский губернский архитектор И.И. Межецкий.
Строительство каменной церкви затянулось на длительный период. По клировым ведомостям, постройка была завершена в 1839 году, а главный престол освящен 25 сентября 1847 года епископом Нижегородским и Арзамасским Иаковом. За время строительства село перешло во владение помещиков Левашовых, которые оказали содействие в завершении работ. В 1827 году был освящен Петропавловский придел, а в 1845 году – Предтеченский придел.
Архитектура храма представляет собой характерный образец сельского храма периода позднего классицизма. Здание построено по принципу «корабль» с продольной осью «восток-запад», включающей основной объем храма с алтарной апсидой, трапезную и пятиярусную колокольню. Основной объем – двухсветный, с деревянным куполом и пятью главами на восьмигранных барабанах. Северный и южный входы оформлены четырехколонными портиками с треугольными фронтонами.
Внутреннее убранство храма включало росписи маслом на голубом фоне, изображающие чудеса Христовы, страдания, а также образы святителей и евангелистов. В алтаре на своде было изображено Всевидящее Око, окруженное ангелами. Иконостасы были позолочены, а полы – деревянными. Храм отапливался двумя печами-голландками, расположенными в трапезной.
В советский период храм избежал полного уничтожения, хотя кресты и купола были сняты. В 2018 году начались реставрационные работы, направленные на восстановление исторического облика здания. Храм является памятником истории и культуры местного значения.