Строительство храма началось летом 2001 года и велось на средства, выделенные из республиканского, городского и районного бюджетов, а также на пожертвования крупных промышленных предприятий республики и частных благотворителей. Имена жертвователей были увековечены на кирпичах, из которых возведены стены храма.
Архитектурный проект храма разработан творческим коллективом под руководством архитектора А. Люпы. В архитектурном отношении храм ориентирован на собор Валаамского монастыря с современным прочтением архитектурных приемов XIX века.
13 марта 2005 года, в Прощеное воскресенье, был отслужен молебен и освящен цокольный этаж храма, где на следующий день состоялось первое богослужение. С тех пор богослужения в храме совершаются регулярно.
12 июня 2010 года митрополит Саранский и Мордовский Варсонофий совершил чин освящения колоколов храма, самый большой из которых весит около 4 тонн.
20 июля 2011 года, во время первосвятительского визита в Мордовию, Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл совершил чин великого освящения храма в честь Казанской иконы Божией Матери и Божественную литургию в новоосвященном храме.
