История храма восходит к XVI веку, когда на этом месте существовала деревянная Покровская кладбищенская церковь села Рождественского-Коврова. К концу XVII века храм пришёл в упадок и прекратил своё существование. В начале 1780-х годов церковь была восстановлена и освящена во имя святого мученика Иоанна Воина.
Строительство каменного храма началось в 1810 году и завершилось в 1827 году. Основные средства на возведение церкви были пожертвованы титулярным советником Петром Борисовичем Ошаниным и ковровским мещанином Иваном Фёдоровичем Апариным. Храм был построен в стиле классицизма, характерном для того времени.
Церковь имеет два престола: главный — во имя великомученика Иоанна Воина и придельный — во имя великомученика Георгия Победоносца. При храме находились каменная колокольня и ограда, а также деревянный дом на каменном фундаменте для членов причта, каменная сторожка и две каменные часовни на кладбище. Причт к церкви был назначен в 1888 году и состоял из священника и псаломщика. Годовой доход причта составлял до 900 рублей.
В 1932 году церковь была передана обновленческой общине. В 1934 году храм был закрыт, а в 1943 году вновь открыт. Однако в 1945 году церковь была закрыта окончательно. Здание использовалось под музей, а позже — как складское помещение.
В 1994 году церковь была возвращена верующим и отремонтирована. В настоящее время храм действует и является памятником архитектуры регионального значения.
