Село Ведлозеро является старинным карельским поселением, первое упоминание о котором относится к 1582–1583 годам.
В 1800 году в селе существовали две церкви: зимняя Никольская и летняя Ильинская, посвящённая пророку Илии. В советский период Ильинская церковь была закрыта, её здание использовалось как спортивный зал, а в начале 1980-х годов было разобрано.
Весной 1997 года православный приход в Ведлозере был возобновлён. Богослужения проводились в здании бывшего детского сада. В июле 2005 года на месте будущего храма был установлен Поклонный крест.
Строительство нового храма началось в сентябре 2005 года. К 26 октября был заложен первый брус, в ноябре возведены стены и крыша, а 10 декабря установлен и освящён крест на храм. Внутренние работы продолжались с января по июнь 2007 года, включая установку окон, дверей и отделку интерьера. 14 июля 2007 года в храме состоялась первая служба, а 2 августа того же года — первый престольный праздник.
Архитектурно храм представляет собой деревянное здание, выполненное в традициях русского деревянного зодчества. Он гармонично вписывается в окружающий ландшафт и продолжает традиции местного храмостроительства.
